На главную страницу второго семестра

Работа сбазой данных InterPro

Анализ информации о домене белка IDH_ECOLI

  • Идентификатор документа — IPR001804 ;
  • Название документа — Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase ;
  • В базе данных InterPro имеется 970 белков, содержащих подпись IPR000595;

Данный документ создан на основании следующих подписей:

База данных Идентификатор Название Количество белков
Pfam PF00180 Iso_dh 966
PROSITE pattern PS00470 IDH_IMDH 869

Отношение родства с другими подписями

    Слева приведено описание отношений родства изучаемой подписи IPR001804 и других подписей, содержащихся в InterPro и удовлетворяющие описанию данной подписи. Данная схема подтверждает, что белки, отвечающие первым шести подписям, полностью описаны подписью IPR001804. Последний совпадает с подписью IPR001804 на 98%. Подпись IPR001804 считается прородительской, а все остальные, содержащиеся в данной схеме называются детьми.
    Перекрывания по аминокислотам в подписях нет.

Описание всех подписей в белке IDH_ECOLI, собранных в базе InterPro

Название подписи Положение в последовательности IDH_ECOLI Расположение мотивов в последовательности белка IDH_ECOLI Полное название базы данных Название организации, поддерживающей данную БД Город и страна
Iso_dh 28-412 Pfam Wellcome Trust Sanger Institute Великобритания, Хинкстон
IDH_IMDH 303-322 Prosite pattern Swiss Institute of Bioinformatics Женева, Швейцария
prok_nadp_idh 1-416 TIGRFAMs The Institute for Genomic Research США, Роквил

© Волкова Екатерина,2005